Seguendo una tradizione secolare, la Scuola organizza concerti di musica sacra (canto gregoriano e polifonico, organo) in collaborazione con lo "Studium Cattolico Veneziano": la rassegna "Musica e Spiritualità" ha avuto inizio in occasione dell'Anno Santo del 2000 e si protrae periodicamente con cicli legati all'anno liturgico.

Alla musica barocca sono invece dedicati alcuni concerti, che si svolgono da primavera a autunno inoltrato, con la partecipazione di solisti di fama mondiale e di complessi italiani e stranieri.